遺傳因素：
部分患兒與遺傳因素有關，遺傳因素對孤單症的作用已趨於明確，患本病的兒童同胞中有2%-6%患本病，單卵雙生子同病率高達36%。
家庭因素：
父母是專業技術人員，受過高等教育，比較聰明，但做事刻板，並有強逼傾向，對孩子冷淡和頑固，家庭缺乏暖和。
腦器質性損害：
如產傷、宮內窒息、感染、中毒等，15%-50%的患兒伴癲癇發作、腦電圖異常、腦CT、磁共振有非特異性改變。有的伴有神經系統體徵、軀體畸形等。先天性風疹病毒感染、鉅細胞病毒感染均可能與自閉症發病有關。
環境因素：
早年生活環境中缺乏豐富和適當的刺激，沒有教以社會行爲。或長期處在單調環境中的兒童，會用反覆動作來進行自我刺激，對外界環境就不發生愛好。
