隨着生活水平的提高，健康問題也越來越受到人們重視，這也促使了一種新型市場模式-功能性水果的推出。日本消費者廳已允許食品進行功能性標註，想要進行標註的食品要先進行安全性評估，如果通過評估，提交的功能性申報纔會被受理。申報的食品中一半左右都是水果。
日本靜岡縣的“三日蜜桔”已於2015年獲得進行功能性標註的權利，稱爲第一種標註功能性的生鮮食品。這種蜜桔中含有的橙色色素“β-隱黃素”，對骨骼代謝有幫助。而受到功能性標註的水果在商店中的存在感提高很多，競爭力得到提高，相應的價格也會提高，很多消費者表示願意接受功能性水果的價格提高。
2018年1月，日本青森縣的“PrimeApple!(富士)”蘋果獲得功能性標註權利，同年12月“王林”也獲得標註資格，這些蘋果中含有多酚，有抗氧化的作用，能抑制內臟脂肪堆積。相應的，這些蘋果的價格要比普通蘋果高3成。
日本目前批准標註功能性的水果逐漸增多，JA全農與長野縣、信州大學合作，針對該縣出產的葡萄“NaganoPurple”作爲功能性標註食品進行申報。該葡萄中含有一種氨基酸，有抑制血壓的作用，如果能成功受理，將成爲第一種可以進行功能性標註的葡萄。
