目前北京90家三級醫院(不含駐京部隊醫院和武警醫院)分佈在覈心區的佔25.8%，空間分佈不合理，加劇了中心城區人口密集、交通擁堵、環境壓力大等社會問題。爲此，“十三五”期間首都功能核心區不再批准建立設置牀位的醫療機構，不再批准增加醫療機構牀位和建設規模。五環路以內禁止新建綜合性醫療機構，不再批准增加政府辦綜合性醫療機構牀位總量。市級以上新建公立醫院單體最大牀位規模不超過1500張，區辦公立綜合醫院最大牀位規模不超過900張。
8家“三甲”醫院將在非核心城區增新址。除了正在進行中的北京天壇醫院(豐臺院區)、北京朝陽醫院(常營院區)、同仁醫院(南院區)之外，北京友誼醫院、北京市中醫醫院、北京口腔醫院、北京兒童醫院、北京婦產醫院等新院區建設也將於“十三五”期間進行。北青報記者瞭解到，目前友誼醫院順義院區正在規劃建設中，其他幾所醫院正在選址階段。
“引導中心城區醫療衛生機構以整體遷建、建設分院等方式向郊區、新城和醫療資源匱乏的大型居住區轉移，同時壓縮原址醫療規模。”市衛計委主任方來英介紹說，目前主要考慮的是建分院，增新址。
在副中心醫療建設方面，推動北京安貞醫院通州院區、北京友誼醫院託管通州新華醫院、東直門醫院通州院區、首都兒科研究所通州院區等項目建設。通過市區兩級共管等機制創新，加強市級醫院對通州區部分二級醫院的技術和管理支撐，構建由不同層級醫院和基層衛生機構共同組成的比較完備的服務體系，並鼓勵社會力量參與北京城市副中心衛生計生事業發展。
