新生兒敗血症的併發症包括膽紅素腦病、化膿性腦膜炎、感染性休克、凝血功能障礙、全身多個臟器功能障礙。
1、膽紅素腦病
新生兒敗血症會導致紅細胞溶血，造成病理性黃疸的發生，嚴重時可導致膽紅素腦病的發生，會有嗜睡及肌張力減弱、吸吮力減弱等症狀。
2、化膿性腦膜炎
細菌不斷感染，得不到控制，會感染到中樞神經系統，導致化膿性腦膜炎的發生，出現噁心、嘔吐、食慾下降及腹脹、發熱等症狀。
3、感染性休克
新生兒血壓會不斷降低，皮膚褶皺多，嚴重時會造成甚至昏迷，甚至會導致感染性休克，威脅到新生兒的生命。
4、凝血功能障礙
敗血症會引起新生兒凝血功能受到障礙，皮膚容易出血，受外力輕輕擠壓，也會有淤青及血腫的症狀，出血後止血比較困難，容易因失血過多造成貧血。
5、全身多個臟器功能障礙
細菌感染到全身，會出現全身症狀，多處器官的功能受到障礙，比較常見的是累及呼吸系統，出現肺炎及肺膿腫等症狀。
