HPV54陽性代表受到人乳頭瘤病毒感染，需要根據病情采取一般治療、物理治療、藥物治療等。
1、一般治療
HPV54屬於低危型人乳頭瘤病毒，大部分可通過自身免疫力消除，建議患者保持良好的飲食習慣和衛生習慣。
2、物理治療
如果感染不嚴重，只是單純的感染，可通過激光、冷凍等物理方法治療。
3、藥物治療
皮膚表面出現疣狀物後，應在醫生的指導下選擇氟尿嘧啶軟膏、維A酸乳膏或者博萊黴素軟膏等藥物治療，可起到局部消除的效果。
另外，還可以通過手術等方式治療。治療過程中應定期複查，謹遵醫囑正確用藥，還應避免直接性接觸，防止引起疾病傳播。
