腎囊腫手術有開放手術和微創手術兩種手術方法。手術需前往正規醫院進行操作，以微創手術爲例，具體步驟如下：
1、患者取截石位躺在手術檯上。麻醉師給予全身麻醉，同時醫生對患者尿道口進行常規消毒，鋪巾。
2、麻醉起效後，醫生經尿道置入導尿管和輸尿管硬鏡到達膀胱，然後在輸尿管硬鏡置入金屬導絲，進入腎臟。
3、將內芯放置於鏡鞘內，再將內芯套到金屬導絲上，在金屬導絲引導下進入腎臟。然後把金屬導絲和內芯退出，獨留鏡鞘。
4、把輸尿管軟鏡置於鏡鞘內進入腎臟，然後再把鈥激光置入輸尿管軟鏡內，進入腎臟內破壞腎囊腫表面。
5、退出鈥激光換成金屬導絲置入腎臟，然後將輸尿管軟鏡退出。
6、dj管在金屬導絲引導下進入腎臟內，將腎囊腫內的囊液全部引導至膀胱內，由導尿管引出體內。
7、在導尿管內無液體流出時，將導尿管和dj管取出體內，手術結束。
術後患者要注意多喝水，勤排尿，飲食清淡。
