二線藥物通常指的是使用一線藥物治療產生抗藥性以後使用的藥物。
在治療疾病的時候，首先會選擇使用一線藥物，如果患者使用一線藥物以後產生耐藥性，或者對疾病起不到緩解作用時，纔會考慮使用二線藥物。二線藥物的治療效果，與一線藥物相比副作用較大，並且療效較差，同時不易耐受，由於具有這些缺點，所以沒有將其推廣使用。無論是一線藥物還是二線藥物，都是針對於某種疾病而言，例如治療肺結核的藥物，一線藥物通常包括異煙肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、鏈黴素，除了這幾種藥物以外，其餘的通常都屬於二線類抗結核的藥物。
在使用二線藥物的時候，可能會導致患者出現一些相關的副作用，此時需要做好相應的保護措施，將藥物的副作用降至最低。
