一跑步就肚子疼的原因可分爲非病理性因素和病理性因素，具體情況解釋如下。
一、非病理性因素
運動前準備活動不充分、運動前吃得太飽或飲水過多，都可以引起一過性的腹痛，而對身體健康沒有實質性影響。
二、病理因素
1、腎結石
運動會幫助結石排出，在排出過程中劃傷尿道，出現疼痛。建議平時多飲水，做一些跳躍運動幫助結石排出。口服排石顆粒，保守治療效果不佳者，選擇體外碎石、或手術治療。
2、膽石症
進食油膩飲食後，膽道系統向腸道中排出膽汁，因此負擔加重，常可誘發膽道系統疾病。膽石症治療以手術切除膽囊治療爲主。手術治療不但療效確定，而且還會避免因膽石症引起的膽道系統惡性腫瘤、膽道梗阻等不良後果。
3、胰腺炎
由於很多人的膽道與胰管共用位於腸道的出口，膽道疾病一旦引起出口的梗阻，還可能誘發胰腺炎。主要抑制胰腺分泌及胰酶活性，而控制病情。生長抑素及奧曲肽可抑制胰腺分泌消化液，加貝酯和抑肽酶可抑制胰蛋白酶的活性。如病情嚴重，還需要手術治療。避免養成不良的飲食習慣，包括三餐不規律；暴飲暴食；進食辛辣飲食，如各種口味濃重的食物；進食大量刺激性食物，如濃茶、濃咖啡、酒。
飲食習慣不良是諸多消化系統疾病的病因，也是主要誘因。儘量減少油炸、醃漬、深加工食物，如炸雞、鹹菜、薯片的攝入。
