一般情況下，可通過咳嗽症狀、血常規檢查、胸部CT檢查的方式，判斷百日咳是否已經痊癒。具體分析如下。
1、咳嗽症狀
百日咳是傳染性疾病，由百日咳桿菌感染所致，如果與感染者密切接觸，或者共用餐具，百日咳桿菌可能會進入人體內，並附着在咽喉、支氣管等部位，進而導致局部細胞變性，使細胞壞死，出現咳嗽、發熱等症狀，並且咳嗽症狀比較劇烈，持續時間較長。如果患者在治療期間，咳嗽症狀逐漸減輕並且消失，呼吸通暢，代表百日咳已經痊癒。
2、血常規檢查
因病竈部位存在炎症因子，受身體免疫系統的影響，白細胞數量會嚴重升高。在患者病情痊癒過後，白細胞的數量會恢復到正常水平。
3、病原學檢查
在患病期間，患者鼻腔分泌物以及口腔中會存在大量的百日咳桿菌，如果患者身體已經痊癒，則體內基本不存在百日咳桿菌，因此可以進行病原學檢查，選擇鼻腔內的分泌物進行判斷。
除此之外，也可以進行熒光抗體染色法、尿常規檢查等。該疾病病程時間較長，因此患者需遵醫囑治療，不可隨意停藥。
