支原體易引起呼吸道和泌尿生殖系統等多個組織臟器的感染，有五種對人類有致病性，分別爲肺炎支原體、發酵支原體、解脲支原體、人型支原體和生殖支原體。致病支原體中，肺炎支原體引起肺炎，發酵支原體、人型支原體、解脲支原體和生殖器支原體主要是感染泌尿生殖系統。
肺部支原體的感染，以兒童多見，最主要的症狀是咳嗽，乾咳爲主，偶有少許白色的粘痰，部分患者有高熱的症狀，檢查主要是支原體抗體陽性，肺部的影像主要表現爲肺部的間質性炎症。
支原體感染泌尿生殖系統，通常會出現尿急、尿頻、尿道燒灼感或尿痛、排尿困難和尿道出現黏液性分泌物或黏液膿性分泌物等症狀。多數患者有急性或亞急性輸卵管炎，還可出現下腹疼痛，惡寒發熱，附件區有觸痛等症狀。
