由於腸道黏膜的炎症和潰瘍越來越厲害，它失去了從殘渣中吸收水分的能力。這樣的話，患者就會排出不成形的糞便，換句話說，這就會導致腹瀉。損傷的腸道黏膜會在糞便表面形成許多粘液，就會形成粘液便。另外，腸道的潰瘍會引起血便，長此以往，最終就會導致貧血。
大多數潰瘍性結腸炎患者的腸道會突然劇烈蠕動，從而引起腹部絞痛。這種疼痛在左下腹更爲明顯，有時也會累及腹部的其他地方。上述這些症狀最終會引起食慾減退和體重下降，再加上貧血，就會出現乏力的表現。患有潰瘍性結腸炎的兒童會出現生長髮育受限。
總體來說，腹痛、腹瀉、粘液膿血便是潰瘍性結腸炎的常見表現。當然還有一些患者合併其他一些腸外的表現，眼睛（表現包括紅腫、疼痛、瘙癢），口腔（疼痛），關節（腫痛、疼痛），皮膚（隆起、破潰、疼痛、皮疹），骨質疏鬆，肝臟（表現包括原發性硬化性膽管炎、肝炎或肝硬化），但這些表現比較少見。
