一般來說益生菌是不可以長期吃的，雖然益生菌它具有調節腸道的微生態這樣的一個良好的作用，有一些益生菌還可以作爲藥物來進行一些疾病的治療，但是長期的吃這種益生菌，它裏邊含有的細菌的種類，它總是有一定限度的，所以它長期使用以後會造成腸道內的一些細菌的比例和失調。
就像我們一個外在的宇宙環境，它需要生物的多樣化，我們腸道的微微環境也需要腸道細菌的多樣化和腸道的有益菌的爲主，所以這種情況如果我們長期吃益生菌，對腸道的菌羣和腸道的正常的一個黏微環境，它的平衡就會造成破壞。
有一些病人就會出現一些腸道菌羣失調導致的這種營養不良，或者會出現一些腹瀉便祕等等一些症狀。所以我們在服用益生菌的時候，一定要根據醫生的醫囑來進行服用，不能夠自己長期的使用，因爲畢竟它是藥物，它不是食物，需要我們在醫生的指導下進行服用。
